水廠供水以及生產本身就是一個復雜的過程，這個環節對于自動化系統的設計要求比較高，在設計的過程中會應用到多種多樣的技術以及設備，因此體現出極大的難度。有一些水廠在自動化設計環節就出現多樣化的問題，導致水廠自動化設備的功能難以得到充分的發揮，甚至會導致相關的設備無法實現正常的運行，嚴重阻礙了水廠的穩定運營及全面發展。
首先，水廠自動化設計的功能不合理。有一些水廠的自動化設計中提的標準太高，在設計一些設備的功能時，就會體現出使用較復雜的特點，同時又忽略了水廠本身的發展狀況以及管理的水平，導致水廠系統中的故障率進一步提高。目對相關的系統設備進行維護管理時，采取的技術本身比較落后，這就會進一步導致相關工藝的自動控制效果無法得到保障，還會有一些水廠的自動化設計功能太過干簡單，根本達不到水廠系統控制的要求，包括一些投藥等關鍵的工藝技術，仍然需要人了去操作完成，這就會導致自動化系統的應用價值無法得到體現。
其次，水廠自動化設計中融入了太多的人工操作功能。有一些水廠自動化設計為了確保自動化系統的運行效果不受到系統故障的影響，設置了很多的人工操作的功能，這就會導致自動化系統本身的效果難以得到充分的體現，這種方式在一定程度上使自動化設備的無效投資增加，也增加了生產人員在工作的過程中的勞動強度。由于設置了太多的人工操作功能，工作人員可能會認為這種設備沒有任何價值，甚至會阻礙他們的工作講度，因此將這種自動化控制設備系統講行閑置，仍然采取取人工操作的方式。
另外，水廠自動化設計工作人員的水平不足。水廠自動化設計的過程中會涉及到太多的技術以及方案，這就要求設計工作人員能夠在掌握先進的控制技術的同時，也能夠熟悉并了解整個系統的生產工藝過程。但是有一些在設計的過程中，由于設計人員本身對于自動化設備的實際情況和設備的技術參數等了解不足，使設計的結果和實際的需求間出現了不匹配現象，或者選擇的設備選型并不是十分合理，無法滿足水廠自動化操作的目標和要求，導致自動化系統的升級效果不理想，無法在水廠的發展過程中發揮良好的效果。
